誤區一認為再生資源經濟只是單純的經濟發展或技術問題，忽視再生資源經濟的系統性和整體性。再生資源經濟并非僅屬于經濟范疇，也不是單純的技術問題，而是一個龐大的系統工程，涉及經濟、科技、社會、文化及環境等一系列可持續發展的基本問題。它從單純的經濟及管理轉向經濟，社會，自然復合生態系統的整合和優化，旨在構建人與自然、人與人和諧發展的社會。誤區二認為發展再生資源經濟只是單純的提高資源利用問題，忽視生態文明的協調發展。再生資源經濟的３Ｒ原則，即資源的減量化、再利用和再循環，但是并不能簡單地理解為資源節約或提高資源利用效率，而是把3R原則貫穿到生產過程、消費環節和整個社會經濟運行之中，實現系統地減少資源消耗并減小環境擾動，在經濟得到發展的同時實現生態系統和經濟系統的協調。誤區之三：認為發展再生資源經濟只是有關部門行為，忽視市場作用和廣大民眾的參與意識。再生資源經濟是一項具有鮮明正外部性的活動，也是一項提供環境公共物品的活動，這意味著有關部門在其中的作用是很重要的，但是并不能就此認為發展再生資源經濟全部是有關部門的責任。首先從道德倫理和社會責任上講，保護環境、節約資源是每一個公民、企業和社會團體的義務，這要靠社會各界自覺履行和主動參與。其次，要發揮市場配置資源的基礎性作用，通過建立資源節約和環境友好的激勵機制和利益機制，引導、鼓勵企業和社會公眾參與再生資源經濟活動，建立起“有關部門主導、企業主體、公眾參與、法律規范、市場推進、政策扶持、科技支撐”的運行機制。

認為發展再生資源經濟主要靠法律等強制性手段保障，忽視經濟手段的引導調節和科學技術的核心作用。當前我國的環保法律仍然是基于末端治理或分段治理，過分強調污染發生后的被動懲罰，難以去掉再生資源經濟發展面臨的問題。所以，發展再生資源經濟除了法制手段外，還應利用經濟手段。同時，在發揮科學技術的核心作用上，突破再生資源經濟發展的技術瓶頸，加快科技投入，支持再生資源經濟共性和關鍵技術繼續研發，開發資源節約和替代技術、能量梯級利用技術、延長產業鏈和相關產業鏈技術、“零排放”技術等，提高再生資源經濟技術開發水平和創新能力，加快新技術、新工藝和新設備的推廣應用。誤區之五：認為發展再生資源經濟僅是工業企業生產問題，忽視區域和社會層面以及其它產業的再生資源經濟發展。發展再生資源經濟包括企業、區域和社會三個層面。應在一些行業形成一批再生資源經濟企業和生態工業園；在有關領域形成若干符合再生資源經濟發展模式的示范區；同時，也要注重在農業、第三產業等其它產業領域大力推進再生資源經濟，逐步形成中國特色的再生資源經濟發展模式，推進節約型社會和循環型社會建設。